Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GCC1Q96CN9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GCC1Q96CN9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GCC1Q96CN9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GCC1Q96CN9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms