Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SNX21Q969T3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNX21Q969T3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX21Q969T3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms