Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APH1BQ8WW43 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APH1BQ8WW43 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APH1BQ8WW43 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms