Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDPRQ8NCN5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDPRQ8NCN5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms