Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC69

KCTD6, BTB/POZ domain-containing protein KCTD6, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD6Q8NC69 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCTD6Q8NC69 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD6Q8NC69 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCTD6Q8NC69 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD6Q8NC69 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD6Q8NC69 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD6Q8NC69 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD6Q8NC69 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD6Q8NC69 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD6Q8NC69 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD6Q8NC69 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD6Q8NC69 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD6Q8NC69 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD6Q8NC69 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCTD6Q8NC69 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCTD6Q8NC69 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms