Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC63Q8NA47 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC63Q8NA47 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC63Q8NA47 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC63Q8NA47 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms