Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHCHD4Q8N4Q1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHCHD4Q8N4Q1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHCHD4Q8N4Q1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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