Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA2D3Q8IZS8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA2D3Q8IZS8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D3Q8IZS8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms