Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUFY3Q7L099 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY3Q7L099 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RUFY3Q7L099 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUFY3Q7L099 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms