Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP47Q6ZTR5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP47Q6ZTR5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP47Q6ZTR5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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