Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDF2Q6PJF5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDF2Q6PJF5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHBDF2Q6PJF5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms