Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SFXN4Q6P4A7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFXN4Q6P4A7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFXN4Q6P4A7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFXN4Q6P4A7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFXN4Q6P4A7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFXN4Q6P4A7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SFXN4Q6P4A7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFXN4Q6P4A7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFXN4Q6P4A7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFXN4Q6P4A7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFXN4Q6P4A7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFXN4Q6P4A7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFXN4Q6P4A7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SFXN4Q6P4A7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFXN4Q6P4A7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFXN4Q6P4A7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFXN4Q6P4A7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFXN4Q6P4A7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFXN4Q6P4A7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms