Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB12Q6IQ22 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB12Q6IQ22 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RAB12Q6IQ22 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB12Q6IQ22 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB12Q6IQ22 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB12Q6IQ22 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB12Q6IQ22 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB12Q6IQ22 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB12Q6IQ22 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB12Q6IQ22 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB12Q6IQ22 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms