Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REP15Q6BDI9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
REP15Q6BDI9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms