Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFMBT2Q5VUG0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SFMBT2Q5VUG0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFMBT2Q5VUG0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms