Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPANXN3Q5MJ09 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPANXN3Q5MJ09 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPANXN3Q5MJ09 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPANXN3Q5MJ09 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPANXN3Q5MJ09 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms