Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRTAP21-3Q3LHN1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRTAP21-3Q3LHN1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KRTAP21-3Q3LHN1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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