Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6LQ2NKX8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERCC6LQ2NKX8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC6LQ2NKX8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6LQ2NKX8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC6LQ2NKX8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms