Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC18A3Q16572 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC18A3Q16572 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
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