Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDCD2Q16342 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCD2Q16342 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDCD2Q16342 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCD2Q16342 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCD2Q16342 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCD2Q16342 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCD2Q16342 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCD2Q16342 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCD2Q16342 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCD2Q16342 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD2Q16342 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD2Q16342 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD2Q16342 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD2Q16342 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD2Q16342 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD2Q16342 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD2Q16342 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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