Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD1Q15797 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD1Q15797 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMAD1Q15797 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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