Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRADDQ15628 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRADDQ15628 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRADDQ15628 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRADDQ15628 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
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