Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNN3Q15417 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNN3Q15417 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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