Protein–RNA interactions for Protein: Q15334

LLGL1, Lethal(2) giant larvae protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL1Q15334 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LLGL1Q15334 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LLGL1Q15334 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LLGL1Q15334 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms