Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGADQ13349 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGADQ13349 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGADQ13349 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms