Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPS1Q13098 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPS1Q13098 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
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