Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 DOT1YDR440W 1749 nt6.36□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 CRH1YGR189C 1524 nt6.36□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 DEF1YKL054C 2217 nt6.36□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 PPH22YDL188C 1134 nt6.36□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 CDC11YJR076C 1248 nt6.36□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 RNH1YMR234W 1047 nt6.36□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 YNL092WYNL092W 1203 nt6.36□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 GUF1YLR289W 1938 nt6.36□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 COQ1YBR003W 1422 nt6.35□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 ASF1YJL115W 840 nt6.35□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 COX10YPL172C 1389 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 PAP1YKR002W 1707 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 LCL3YGL085W 825 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 YHM2YMR241W 945 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 MSS116YDR194C 1995 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 YHK8YHR048W 1545 nt6.34□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 HSM3YBR272C 1443 nt6.33□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 FMO1YHR176W 1299 nt6.33□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 YKL102CYKL102C 306 nt6.33□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 TAF9YMR236W 474 nt6.33□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 LSC1YOR142W 990 nt6.33□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 AIM3YBR108W 2844 nt6.33□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 SLA2YNL243W 2907 nt6.32□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 YKL077WYKL077W 1179 nt6.32□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 RFC4YOL094C 972 nt6.32□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 YBR113WYBR113W 483 nt6.32□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 YLL066CYLL066C 3618 nt6.32□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 PEX31YGR004W 1389 nt6.31□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 YRB2YIL063C 984 nt6.31□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 MRPS18YNL306W 654 nt6.31□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 YOR111WYOR111W 699 nt6.31□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 RPL5YPL131W 894 nt6.31□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 STT3YGL022W 2157 nt6.31□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 SAL1YNL083W 1485 nt6.3□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 YDR415CYDR415C 1125 nt6.3□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 HIS1YER055C 894 nt6.3□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.3□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 YAR064WYAR064W 300 nt6.3□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 CUE4YML101C 354 nt6.3□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 MSN2YMR037C 2115 nt6.3□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 ARA2YMR041C 1008 nt6.3□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 MRPL23YOR150W 492 nt6.3□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 OPI11YPR044C 354 nt6.3□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 EDE1YBL047C 4146 nt6.3□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 BDF2YDL070W 1917 nt6.29□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 MIA40YKL195W 1212 nt6.29□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 KSH1YNL024C-A 219 nt6.29□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 ADH5YBR145W 1056 nt6.29□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 GLN3YER040W 2193 nt6.28□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 ECM38YLR299W 1983 nt6.28□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 YMR027WYMR027W 1413 nt6.28□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 YPT1YFL038C 621 nt6.28□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 DYS1YHR068W 1164 nt6.28□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 YJR107WYJR107W 987 nt6.28□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 YKR032WYKR032W 315 nt6.28□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 TOS6YNL300W 309 nt6.28□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 ARP3YJR065C 1350 nt6.28□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 APM4YOL062C 1476 nt6.28□□□□□ -1.4
NMD4Q12129 PRY3YJL078C 2646 nt6.27□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 YDL023CYDL023C 321 nt6.27□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 GCG1YER163C 699 nt6.27□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 YJR146WYJR146W 354 nt6.27□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.27□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 BPL1YDL141W 2073 nt6.26□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 FPR2YDR519W 408 nt6.26□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt6.26□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 OPI8YKR035C 642 nt6.26□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 DFR1YOR236W 636 nt6.26□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 ILV6YCL009C 930 nt6.26□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 HEM1YDR232W 1647 nt6.25□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 CNM67YNL225C 1746 nt6.25□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 IMG1YCR046C 510 nt6.25□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 CTF8YHR191C 402 nt6.25□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.25□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 OGG1YML060W 1131 nt6.25□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 RUF23RUF23 254 nt6.25□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 VPS72YDR485C 2388 nt6.25□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 GYP8YFL027C 1494 nt6.24□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 FAL1YDR021W 1200 nt6.24□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 OM45YIL136W 1182 nt6.24□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 SUR7YML052W 909 nt6.24□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 YPL257WYPL257W 582 nt6.24□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 SKI2YLR398C 3864 nt6.24□□□□□ -1.41
NMD4Q12129 DAL4YIR028W 1908 nt6.23□□□□□ -1.41
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