Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4CQ08493 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE4CQ08493 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4CQ08493 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms