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Protein–RNA interactions for Protein: Q08490
SGO1, Shugoshin, yeast
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590 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SGO1
Q08490
ECM27
YJR106W
2178 nt
6.85
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
CYB2
YML054C
1776 nt
6.85
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
PGI1
YBR196C
1665 nt
6.85
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
RAD59
YDL059C
717 nt
6.85
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
snR78
snR78
87 nt
6.85
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
SEN34
YAR008W
828 nt
6.85
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
RPL43A
YPR043W
279 nt
6.85
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
YOS9
YDR057W
1629 nt
6.84
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
YBL081W
YBL081W
1107 nt
6.84
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
GPH1
YPR160W
2709 nt
6.84
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
YLL066C
YLL066C
3618 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
REV7
YIL139C
738 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
YHC3
YJL059W
1227 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
TIF2
YJL138C
1188 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
YAL045C
YAL045C
309 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
TIF1
YKR059W
1188 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
SNN1
YNL086W
309 nt
6.83
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
YHR140W
YHR140W
720 nt
6.82
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
MOG1
YJR074W
657 nt
6.82
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
YKL077W
YKL077W
1179 nt
6.82
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
GPA2
YER020W
1350 nt
6.82
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
CDC7
YDL017W
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6.81
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
DSF1
YEL070W
1509 nt
6.81
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
YNR073C
YNR073C
1509 nt
6.81
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
ELP3
YPL086C
1674 nt
6.81
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
GSH1
YJL101C
2037 nt
6.81
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
RNH1
YMR234W
1047 nt
6.81
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
SMX3
YPR182W
261 nt
6.81
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
VMA2
YBR127C
1554 nt
6.81
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
ECM38
YLR299W
1983 nt
6.8
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
UIP5
YKR044W
1332 nt
6.8
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
UBP13
YBL067C
2244 nt
6.8
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
YDR327W
YDR327W
327 nt
6.8
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
MMS21
YEL019C
804 nt
6.8
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
URE2
YNL229C
1065 nt
6.8
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
ARC35
YNR035C
1029 nt
6.8
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
AIM41
YOR215C
558 nt
6.8
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
MOD5
YOR274W
1287 nt
6.8
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
CDS1
YBR029C
1374 nt
6.8
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
DLD1
YDL174C
1764 nt
6.8
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
FPR2
YDR519W
408 nt
6.79
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
YHL018W
YHL018W
363 nt
6.79
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
REC107
YJR021C
945 nt
6.79
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
TAF11
YML015C
1041 nt
6.79
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
GLN3
YER040W
2193 nt
6.79
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
IVY1
YDR229W
1362 nt
6.79
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
MCH2
YKL221W
1422 nt
6.78
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
RRP1
YDR087C
837 nt
6.78
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
YHP1
YDR451C
1062 nt
6.78
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
Q0144
Q0144
330 nt
6.78
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
MPC2
YHR162W
390 nt
6.78
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
TPK1
YJL164C
1194 nt
6.78
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
PRE2
YPR103W
864 nt
6.78
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
PCL10
YGL134W
1302 nt
6.77
□□□□□ -1.32
SGO1
Q08490
CTF8
YHR191C
402 nt
6.77
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
BUD9
YGR041W
1644 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
CDC10
YCR002C
969 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
MRPS28
YDR337W
861 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
YDR401W
YDR401W
564 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
PTC7
YHR076W
1032 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
HMS2
YJR147W
1077 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
MRPL24
YMR193W
777 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
SCS7
YMR272C
1155 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
SEC62
YPL094C
825 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
DAL7
YIR031C
1665 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
BDF2
YDL070W
1917 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
VBA5
YKR105C
1749 nt
6.76
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
CDC16
YKL022C
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6.75
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
YDL172C
YDL172C
480 nt
6.75
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
SHO1
YER118C
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□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
SYF2
YGR129W
648 nt
6.75
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
MTR3
YGR158C
753 nt
6.75
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
CSL4
YNL232W
879 nt
6.75
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
YPL102C
YPL102C
303 nt
6.75
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
ERS1
YCR075C
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6.74
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
YEL074W
YEL074W
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6.74
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
QCR6
YFR033C
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SGO1
Q08490
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YKL018C-A
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SGO1
Q08490
SPG5
YMR191W
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SGO1
Q08490
YNL017C
YNL017C
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6.74
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
YNR048W
YNR048W
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6.74
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
MRPL23
YOR150W
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SGO1
Q08490
OPI11
YPR044C
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□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
YBR226C
YBR226C
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6.74
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
TRP1
YDR007W
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□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
GTT3
YEL017W
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□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
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SGO1
Q08490
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YER147C-A
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□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
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□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
SWD1
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SGO1
Q08490
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□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
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□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
YPR196W
YPR196W
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6.73
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
PPH22
YDL188C
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□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
HPT1
YDR399W
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6.72
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
HSP12
YFL014W
330 nt
6.72
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
ERP5
YHR110W
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6.72
□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
YBR241C
YBR241C
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□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
CCT3
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□□□□□ -1.33
SGO1
Q08490
YIL092W
YIL092W
1902 nt
6.72
□□□□□ -1.33
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