Protein–RNA interactions for Protein: Q08380

LGALS3BP, Galectin-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3BPQ08380 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGALS3BPQ08380 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGALS3BPQ08380 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms