Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EGR3Q06889 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EGR3Q06889 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EGR3Q06889 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EGR3Q06889 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EGR3Q06889 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EGR3Q06889 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
EGR3Q06889 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EGR3Q06889 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EGR3Q06889 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EGR3Q06889 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EGR3Q06889 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EGR3Q06889 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EGR3Q06889 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EGR3Q06889 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EGR3Q06889 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EGR3Q06889 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EGR3Q06889 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EGR3Q06889 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EGR3Q06889 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EGR3Q06889 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EGR3Q06889 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EGR3Q06889 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EGR3Q06889 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EGR3Q06889 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EGR3Q06889 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EGR3Q06889 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EGR3Q06889 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EGR3Q06889 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EGR3Q06889 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EGR3Q06889 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms