Protein–RNA interactions for Protein: Q02630

NUP116, Nucleoporin NUP116/NSP116, yeastyeast

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP116Q02630 AIM20YIL158W 615 nt6.03□□□□□ -1.44
NUP116Q02630 CIS3YJL158C 684 nt6.03□□□□□ -1.44
NUP116Q02630 YDR387CYDR387C 1668 nt6.03□□□□□ -1.44
NUP116Q02630 JIP4YDR475C 2631 nt6.03□□□□□ -1.44
NUP116Q02630 PEX13YLR191W 1161 nt6.02□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 IMD1YAR073W 1212 nt6.02□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 YOL046CYOL046C 675 nt6.02□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 TMA46YOR091W 1038 nt6.02□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 YFR006WYFR006W 1608 nt6.02□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 COX15YER141W 1461 nt6.02□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 UTR2YEL040W 1404 nt6.01□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 NUP49YGL172W 1419 nt6.01□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 BIO3YNR058W 1443 nt6.01□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 ICP55YER078C 1536 nt6.01□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 POX1YGL205W 2247 nt6.01□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 FAF1YIL019W 1041 nt6.01□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 SWD1YAR003W 1281 nt6.01□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 IMA5YJL216C 1746 nt6.01□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 HIS7YBR248C 1659 nt6.01□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 YIL055CYIL055C 1884 nt6□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 PPH21YDL134C 1110 nt6□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 FYV1YDR024W 486 nt6□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 EDE1YBL047C 4146 nt6□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 CYS4YGR155W 1524 nt5.99□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 RAP1YNL216W 2484 nt5.99□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 TPO3YPR156C 1869 nt5.99□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 PPM1YDR435C 987 nt5.99□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 AGX1YFL030W 1158 nt5.99□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 ATG36YJL185C 882 nt5.99□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt5.99□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 FBA1YKL060C 1080 nt5.99□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 IDP3YNL009W 1263 nt5.99□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 ASR1YPR093C 867 nt5.99□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 YBR113WYBR113W 483 nt5.99□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 HXT2YMR011W 1626 nt5.99□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 MSC3YLR219W 2187 nt5.99□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 MIP1YOR330C 3765 nt5.98□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 YHR020WYHR020W 2067 nt5.98□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 PPM2YOL141W 2088 nt5.98□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 YTH1YPR107C 627 nt5.98□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 ATG22YCL038C 1587 nt5.97□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 CCC2YDR270W 3015 nt5.97□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 CRP1YHR146W 1398 nt5.97□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 RPP1YHR062C 882 nt5.97□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 CDC16YKL022C 2523 nt5.97□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 HXT17YNR072W 1695 nt5.97□□□□□ -1.45
NUP116Q02630 ALT2YDR111C 1524 nt5.96□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 GEF1YJR040W 2340 nt5.96□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 GPI11YDR302W 660 nt5.96□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 IRC7YFR055W 1023 nt5.96□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 DUS4YLR405W 1104 nt5.96□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 KEL1YHR158C 3495 nt5.95□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 HED1YDR014W-A 489 nt5.95□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 RRP46YGR095C 672 nt5.95□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 CSM2YIL132C 642 nt5.95□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 MIA40YKL195W 1212 nt5.95□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 LDB7YBL006C 543 nt5.95□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 SCS22YBL091C-A 528 nt5.95□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 MOD5YOR274W 1287 nt5.95□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 SEC62YPL094C 825 nt5.95□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 RIX7YLL034C 2514 nt5.95□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 KDX1YKL161C 1302 nt5.95□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 STT3YGL022W 2157 nt5.94□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 THI2YBR240C 1353 nt5.94□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 YGR139WYGR139W 339 nt5.94□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 SQT1YIR012W 1296 nt5.94□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 YNL017CYNL017C 339 nt5.94□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 YML133CYML133C 4125 nt5.93□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 COQ1YBR003W 1422 nt5.93□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 COX9YDL067C 180 nt5.93□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 LIA1YJR070C 978 nt5.93□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 HOC1YJR075W 1191 nt5.93□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 YML6YML025C 861 nt5.93□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 PXL1YKR090W 2121 nt5.93□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 GPD2YOL059W 1323 nt5.93□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 VPS61YDR136C 573 nt5.92□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 KSH1YNL024C-A 219 nt5.92□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.92□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 COX10YPL172C 1389 nt5.92□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 EMW1YNL313C 2715 nt5.91□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 YKL153WYKL153W 510 nt5.91□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 YLR123CYLR123C 330 nt5.91□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 RNH1YMR234W 1047 nt5.91□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 DFR1YOR236W 636 nt5.91□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 DOT1YDR440W 1749 nt5.91□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 MSY1YPL097W 1479 nt5.9□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 GAA1YLR088W 1845 nt5.9□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 CCP1YKR066C 1086 nt5.9□□□□□ -1.46
NUP116Q02630 FMP40YPL222W 2067 nt5.9□□□□□ -1.47
NUP116Q02630 YHK8YHR048W 1545 nt5.89□□□□□ -1.47
NUP116Q02630 DMA1YHR115C 1251 nt5.89□□□□□ -1.47
NUP116Q02630 MDH1YKL085W 1005 nt5.89□□□□□ -1.47
NUP116Q02630 PUS5YLR165C 765 nt5.89□□□□□ -1.47
NUP116Q02630 RFC4YOL094C 972 nt5.89□□□□□ -1.47
NUP116Q02630 PRY3YJL078C 2646 nt5.89□□□□□ -1.47
NUP116Q02630 LDB19YOR322C 2457 nt5.88□□□□□ -1.47
NUP116Q02630 CHS5YLR330W 2016 nt5.88□□□□□ -1.47
NUP116Q02630 ASF1YJL115W 840 nt5.88□□□□□ -1.47
NUP116Q02630 YKL077WYKL077W 1179 nt5.88□□□□□ -1.47
NUP116Q02630 YNL120CYNL120C 486 nt5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.6 ms