Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A2Q01362 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A2Q01362 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms