Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MDM2Q00987 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MDM2Q00987 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MDM2Q00987 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms