Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SUMO1P63165 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUMO1P63165 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SUMO1P63165 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SUMO1P63165 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SUMO1P63165 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms