Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113P63121 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERVK_113P63121 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63121 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms