Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MVDP53602 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MVDP53602 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVDP53602 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVDP53602 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVDP53602 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVDP53602 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVDP53602 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVDP53602 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MVDP53602 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MVDP53602 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MVDP53602 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MVDP53602 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MVDP53602 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MVDP53602 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MVDP53602 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MVDP53602 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MVDP53602 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MVDP53602 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MVDP53602 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MVDP53602 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MVDP53602 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MVDP53602 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MVDP53602 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MVDP53602 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MVDP53602 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MVDP53602 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MVDP53602 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MVDP53602 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MVDP53602 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MVDP53602 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MVDP53602 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MVDP53602 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MVDP53602 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MVDP53602 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MVDP53602 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MVDP53602 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVDP53602 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVDP53602 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVDP53602 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVDP53602 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVDP53602 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVDP53602 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVDP53602 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVDP53602 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVDP53602 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVDP53602 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVDP53602 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVDP53602 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVDP53602 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MVDP53602 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVDP53602 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVDP53602 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MVDP53602 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MVDP53602 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MVDP53602 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MVDP53602 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MVDP53602 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MVDP53602 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MVDP53602 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MVDP53602 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MVDP53602 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MVDP53602 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MVDP53602 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MVDP53602 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MVDP53602 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MVDP53602 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MVDP53602 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MVDP53602 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MVDP53602 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MVDP53602 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MVDP53602 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MVDP53602 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MVDP53602 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MVDP53602 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MVDP53602 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MVDP53602 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MVDP53602 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MVDP53602 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MVDP53602 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MVDP53602 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MVDP53602 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MVDP53602 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MVDP53602 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MVDP53602 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MVDP53602 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MVDP53602 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MVDP53602 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MVDP53602 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MVDP53602 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MVDP53602 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MVDP53602 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MVDP53602 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MVDP53602 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MVDP53602 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MVDP53602 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MVDP53602 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MVDP53602 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MVDP53602 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MVDP53602 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms