Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOSBP53539 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOSBP53539 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOSBP53539 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOSBP53539 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOSBP53539 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOSBP53539 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOSBP53539 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOSBP53539 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOSBP53539 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOSBP53539 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOSBP53539 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOSBP53539 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOSBP53539 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOSBP53539 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOSBP53539 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOSBP53539 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOSBP53539 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOSBP53539 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOSBP53539 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOSBP53539 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FOSBP53539 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOSBP53539 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOSBP53539 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOSBP53539 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
FOSBP53539 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOSBP53539 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOSBP53539 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOSBP53539 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOSBP53539 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOSBP53539 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOSBP53539 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOSBP53539 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOSBP53539 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOSBP53539 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOSBP53539 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOSBP53539 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOSBP53539 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOSBP53539 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOSBP53539 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOSBP53539 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOSBP53539 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOSBP53539 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOSBP53539 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOSBP53539 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOSBP53539 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOSBP53539 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOSBP53539 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOSBP53539 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOSBP53539 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOSBP53539 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOSBP53539 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOSBP53539 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOSBP53539 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOSBP53539 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOSBP53539 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOSBP53539 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOSBP53539 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOSBP53539 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOSBP53539 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOSBP53539 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOSBP53539 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOSBP53539 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOSBP53539 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOSBP53539 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOSBP53539 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FOSBP53539 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOSBP53539 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOSBP53539 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOSBP53539 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOSBP53539 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOSBP53539 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOSBP53539 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOSBP53539 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOSBP53539 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FOSBP53539 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOSBP53539 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOSBP53539 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOSBP53539 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOSBP53539 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOSBP53539 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOSBP53539 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOSBP53539 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOSBP53539 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOSBP53539 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOSBP53539 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOSBP53539 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOSBP53539 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOSBP53539 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOSBP53539 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOSBP53539 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOSBP53539 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FOSBP53539 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FOSBP53539 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FOSBP53539 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOSBP53539 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOSBP53539 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOSBP53539 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOSBP53539 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOSBP53539 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms