Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LUMP51884 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LUMP51884 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LUMP51884 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LUMP51884 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LUMP51884 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LUMP51884 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LUMP51884 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LUMP51884 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LUMP51884 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LUMP51884 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LUMP51884 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LUMP51884 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LUMP51884 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LUMP51884 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LUMP51884 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LUMP51884 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LUMP51884 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LUMP51884 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LUMP51884 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LUMP51884 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LUMP51884 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LUMP51884 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LUMP51884 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LUMP51884 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LUMP51884 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LUMP51884 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LUMP51884 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LUMP51884 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LUMP51884 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LUMP51884 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LUMP51884 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LUMP51884 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LUMP51884 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LUMP51884 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LUMP51884 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LUMP51884 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LUMP51884 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LUMP51884 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LUMP51884 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LUMP51884 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LUMP51884 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LUMP51884 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LUMP51884 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LUMP51884 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LUMP51884 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LUMP51884 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LUMP51884 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LUMP51884 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LUMP51884 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LUMP51884 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LUMP51884 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LUMP51884 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LUMP51884 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LUMP51884 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LUMP51884 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LUMP51884 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LUMP51884 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LUMP51884 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LUMP51884 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LUMP51884 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LUMP51884 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LUMP51884 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LUMP51884 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LUMP51884 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LUMP51884 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LUMP51884 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LUMP51884 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LUMP51884 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LUMP51884 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LUMP51884 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LUMP51884 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LUMP51884 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LUMP51884 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LUMP51884 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LUMP51884 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LUMP51884 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LUMP51884 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LUMP51884 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
LUMP51884 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LUMP51884 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LUMP51884 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LUMP51884 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LUMP51884 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LUMP51884 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LUMP51884 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LUMP51884 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LUMP51884 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LUMP51884 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LUMP51884 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LUMP51884 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LUMP51884 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LUMP51884 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LUMP51884 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LUMP51884 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LUMP51884 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LUMP51884 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LUMP51884 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LUMP51884 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LUMP51884 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms