Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POU3F4P49335 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POU3F4P49335 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POU3F4P49335 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms