Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMAN1P49257 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMAN1P49257 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169 ms