Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AFMP43652 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AFMP43652 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AFMP43652 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
AFMP43652 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFMP43652 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFMP43652 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFMP43652 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFMP43652 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFMP43652 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFMP43652 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFMP43652 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFMP43652 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFMP43652 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AFMP43652 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFMP43652 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFMP43652 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFMP43652 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFMP43652 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFMP43652 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AFMP43652 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
AFMP43652 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AFMP43652 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AFMP43652 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFMP43652 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFMP43652 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFMP43652 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFMP43652 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFMP43652 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFMP43652 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFMP43652 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFMP43652 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFMP43652 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFMP43652 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFMP43652 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFMP43652 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFMP43652 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFMP43652 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFMP43652 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFMP43652 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AFMP43652 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AFMP43652 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AFMP43652 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFMP43652 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFMP43652 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFMP43652 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFMP43652 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFMP43652 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFMP43652 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFMP43652 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AFMP43652 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AFMP43652 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AFMP43652 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AFMP43652 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AFMP43652 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AFMP43652 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AFMP43652 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AFMP43652 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AFMP43652 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AFMP43652 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AFMP43652 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AFMP43652 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AFMP43652 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
AFMP43652 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
AFMP43652 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AFMP43652 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AFMP43652 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFMP43652 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
AFMP43652 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFMP43652 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFMP43652 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFMP43652 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFMP43652 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFMP43652 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFMP43652 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFMP43652 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFMP43652 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFMP43652 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AFMP43652 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFMP43652 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFMP43652 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFMP43652 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFMP43652 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AFMP43652 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
AFMP43652 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
AFMP43652 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AFMP43652 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AFMP43652 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AFMP43652 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AFMP43652 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AFMP43652 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AFMP43652 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AFMP43652 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AFMP43652 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AFMP43652 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
AFMP43652 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AFMP43652 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFMP43652 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFMP43652 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AFMP43652 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms