Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSKP43235 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSKP43235 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSKP43235 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSKP43235 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSKP43235 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSKP43235 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSKP43235 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSKP43235 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSKP43235 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSKP43235 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSKP43235 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSKP43235 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSKP43235 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSKP43235 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSKP43235 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSKP43235 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSKP43235 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSKP43235 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSKP43235 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSKP43235 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSKP43235 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSKP43235 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSKP43235 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSKP43235 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSKP43235 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSKP43235 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSKP43235 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSKP43235 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSKP43235 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSKP43235 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSKP43235 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSKP43235 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSKP43235 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSKP43235 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSKP43235 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSKP43235 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSKP43235 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSKP43235 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSKP43235 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSKP43235 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSKP43235 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSKP43235 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSKP43235 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSKP43235 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSKP43235 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSKP43235 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSKP43235 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSKP43235 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSKP43235 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSKP43235 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSKP43235 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSKP43235 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSKP43235 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSKP43235 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSKP43235 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSKP43235 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSKP43235 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSKP43235 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSKP43235 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSKP43235 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSKP43235 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSKP43235 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSKP43235 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSKP43235 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSKP43235 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSKP43235 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSKP43235 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSKP43235 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSKP43235 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSKP43235 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSKP43235 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSKP43235 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSKP43235 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSKP43235 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSKP43235 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSKP43235 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSKP43235 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSKP43235 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSKP43235 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSKP43235 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSKP43235 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSKP43235 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSKP43235 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSKP43235 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSKP43235 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSKP43235 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSKP43235 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSKP43235 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSKP43235 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSKP43235 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSKP43235 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSKP43235 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSKP43235 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSKP43235 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSKP43235 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSKP43235 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSKP43235 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSKP43235 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSKP43235 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms