Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTGFRP43088 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTGFRP43088 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms