Protein–RNA interactions for Protein: P35442

THBS2, Thrombospondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS2P35442 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THBS2P35442 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THBS2P35442 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THBS2P35442 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THBS2P35442 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THBS2P35442 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
THBS2P35442 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
THBS2P35442 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
THBS2P35442 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
THBS2P35442 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
THBS2P35442 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
THBS2P35442 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
THBS2P35442 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
THBS2P35442 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
THBS2P35442 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
THBS2P35442 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THBS2P35442 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
THBS2P35442 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THBS2P35442 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THBS2P35442 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THBS2P35442 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
THBS2P35442 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
THBS2P35442 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THBS2P35442 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THBS2P35442 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
THBS2P35442 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THBS2P35442 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THBS2P35442 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THBS2P35442 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THBS2P35442 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THBS2P35442 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THBS2P35442 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THBS2P35442 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THBS2P35442 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THBS2P35442 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THBS2P35442 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
THBS2P35442 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
THBS2P35442 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THBS2P35442 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
THBS2P35442 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
THBS2P35442 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
THBS2P35442 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
THBS2P35442 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
THBS2P35442 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
THBS2P35442 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
THBS2P35442 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS2P35442 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS2P35442 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS2P35442 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS2P35442 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS2P35442 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS2P35442 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS2P35442 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS2P35442 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THBS2P35442 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
THBS2P35442 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
THBS2P35442 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THBS2P35442 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THBS2P35442 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THBS2P35442 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THBS2P35442 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THBS2P35442 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THBS2P35442 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THBS2P35442 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THBS2P35442 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THBS2P35442 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THBS2P35442 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THBS2P35442 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THBS2P35442 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THBS2P35442 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
THBS2P35442 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
THBS2P35442 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THBS2P35442 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THBS2P35442 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
THBS2P35442 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THBS2P35442 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
THBS2P35442 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THBS2P35442 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THBS2P35442 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THBS2P35442 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
THBS2P35442 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THBS2P35442 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THBS2P35442 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THBS2P35442 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
THBS2P35442 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THBS2P35442 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THBS2P35442 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THBS2P35442 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THBS2P35442 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THBS2P35442 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THBS2P35442 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THBS2P35442 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THBS2P35442 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THBS2P35442 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THBS2P35442 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THBS2P35442 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THBS2P35442 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THBS2P35442 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THBS2P35442 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THBS2P35442 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms