Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNA1P35221 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNA1P35221 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTNNA1P35221 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms