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Protein–RNA interactions for Protein: P32500
NDC1, Nucleoporin NDC1, yeast
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655 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
NDC1
P32500
RPP1
YHR062C
882 nt
6.03
□□□□□ -1.44
NDC1
P32500
DID2
YKR035W-A
615 nt
6.03
□□□□□ -1.44
NDC1
P32500
YLL056C
YLL056C
897 nt
6.03
□□□□□ -1.44
NDC1
P32500
ATG17
YLR423C
1254 nt
6.03
□□□□□ -1.44
NDC1
P32500
YNL120C
YNL120C
486 nt
6.03
□□□□□ -1.44
NDC1
P32500
ERG10
YPL028W
1197 nt
6.03
□□□□□ -1.44
NDC1
P32500
HXK2
YGL253W
1461 nt
6.02
□□□□□ -1.44
NDC1
P32500
SWD1
YAR003W
1281 nt
6.02
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
YPL250W-A
YPL250W-A
288 nt
6.02
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
MPA43
YNL249C
1629 nt
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□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
EDC2
YER035W
438 nt
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□□□□□ -1.45
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P32500
THI4
YGR144W
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□□□□□ -1.45
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P32500
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YLR123C
330 nt
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□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
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YML079W
606 nt
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□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
GYP8
YFL027C
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□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
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YKL018C-A
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6
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
MRPL19
YNL185C
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6
□□□□□ -1.45
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P32500
FIT2
YOR382W
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6
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P32500
CRP1
YHR146W
1398 nt
6
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
CCC2
YDR270W
3015 nt
5.99
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
SLX5
YDL013W
1860 nt
5.99
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
YNL067W-A
YNL067W-A
147 nt
5.99
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
RFC4
YOL094C
972 nt
5.99
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
YJL163C
YJL163C
1668 nt
5.98
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
YJR146W
YJR146W
354 nt
5.98
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
YNL092W
YNL092W
1203 nt
5.98
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
MKK1
YOR231W
1527 nt
5.98
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
PXL1
YKR090W
2121 nt
5.98
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
COX10
YPL172C
1389 nt
5.97
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
FZF1
YGL254W
900 nt
5.97
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
ICS3
YJL077C
396 nt
5.97
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
YAL019W-A
YAL019W-A
570 nt
5.97
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
YKL077W
YKL077W
1179 nt
5.97
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
KSH1
YNL024C-A
219 nt
5.97
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
ATP4
YPL078C
735 nt
5.97
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
SKI2
YLR398C
3864 nt
5.97
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
MFG1
YDL233W
1377 nt
5.96
□□□□□ -1.45
NDC1
P32500
VHT1
YGR065C
1782 nt
5.96
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
AIM24
YJR080C
1185 nt
5.96
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
RKI1
YOR095C
777 nt
5.96
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
ALT2
YDR111C
1524 nt
5.95
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
PUP2
YGR253C
783 nt
5.95
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
GEF1
YJR040W
2340 nt
5.95
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
CCP1
YKR066C
1086 nt
5.95
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
OGG1
YML060W
1131 nt
5.95
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
COQ3
YOL096C
939 nt
5.95
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
MRPL23
YOR150W
492 nt
5.95
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
MOD5
YOR274W
1287 nt
5.95
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
YPL257W
YPL257W
582 nt
5.95
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
RSA4
YCR072C
1548 nt
5.94
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
CIS3
YJL158C
684 nt
5.94
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
SML1
YML058W
315 nt
5.94
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
KTR5
YNL029C
1569 nt
5.93
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
VPS61
YDR136C
573 nt
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NDC1
P32500
SHO1
YER118C
1104 nt
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NDC1
P32500
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YHR115C
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P32500
REG2
YBR050C
1017 nt
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NDC1
P32500
NSE5
YML023C
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NDC1
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PGM1
YKL127W
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5.93
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NDC1
P32500
TPO3
YPR156C
1869 nt
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□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
IMA5
YJL216C
1746 nt
5.92
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
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YOL046C
675 nt
5.92
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
YPL277C
YPL277C
1464 nt
5.91
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
CIT3
YPR001W
1461 nt
5.91
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
PFK2
YMR205C
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5.91
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NDC1
P32500
AGX1
YFL030W
1158 nt
5.91
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NDC1
P32500
DUS4
YLR405W
1104 nt
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□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
SWP1
YMR149W
861 nt
5.91
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
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YPR076W
375 nt
5.91
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NDC1
P32500
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YDR329C
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□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
ATF1
YOR377W
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□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
FAL1
YDR021W
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5.9
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
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YBL070C
321 nt
5.9
□□□□□ -1.46
NDC1
P32500
RGD1
YBR260C
2001 nt
5.9
□□□□□ -1.47
NDC1
P32500
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YFR006W
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5.89
□□□□□ -1.47
NDC1
P32500
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660 nt
5.89
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NDC1
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YDR435C
987 nt
5.89
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NDC1
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AIM46
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YNL310C
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P32500
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YOR268C
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867 nt
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NDC1
P32500
YBR226C
YBR226C
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5.89
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NDC1
P32500
CSC1
YLR241W
2349 nt
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NDC1
P32500
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YGR054W
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5.88
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NDC1
P32500
QCR8
YJL166W
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NDC1
P32500
MDE1
YJR024C
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NDC1
P32500
BSC4
YNL269W
396 nt
5.88
□□□□□ -1.47
NDC1
P32500
NMT1
YLR195C
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NDC1
P32500
KEL1
YHR158C
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NDC1
P32500
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□□□□□ -1.47
NDC1
P32500
PPH21
YDL134C
1110 nt
5.87
□□□□□ -1.47
NDC1
P32500
YRB2
YIL063C
984 nt
5.87
□□□□□ -1.47
NDC1
P32500
COA1
YIL157C
594 nt
5.87
□□□□□ -1.47
NDC1
P32500
YKL102C
YKL102C
306 nt
5.87
□□□□□ -1.47
NDC1
P32500
YML6
YML025C
861 nt
5.87
□□□□□ -1.47
NDC1
P32500
YOX1
YML027W
1158 nt
5.87
□□□□□ -1.47
NDC1
P32500
LDB16
YCL005W
771 nt
5.87
□□□□□ -1.47
NDC1
P32500
RMD9
YGL107C
1941 nt
5.87
□□□□□ -1.47
NDC1
P32500
POX1
YGL205W
2247 nt
5.87
□□□□□ -1.47
NDC1
P32500
LAT1
YNL071W
1449 nt
5.86
□□□□□ -1.47
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