Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LAP3P28838 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAP3P28838 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAP3P28838 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAP3P28838 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAP3P28838 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAP3P28838 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAP3P28838 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAP3P28838 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAP3P28838 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAP3P28838 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAP3P28838 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAP3P28838 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAP3P28838 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAP3P28838 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAP3P28838 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAP3P28838 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAP3P28838 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAP3P28838 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAP3P28838 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAP3P28838 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAP3P28838 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAP3P28838 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAP3P28838 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAP3P28838 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAP3P28838 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAP3P28838 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAP3P28838 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAP3P28838 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAP3P28838 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAP3P28838 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAP3P28838 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAP3P28838 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAP3P28838 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAP3P28838 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAP3P28838 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAP3P28838 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAP3P28838 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAP3P28838 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAP3P28838 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAP3P28838 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAP3P28838 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAP3P28838 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAP3P28838 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LAP3P28838 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LAP3P28838 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAP3P28838 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAP3P28838 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAP3P28838 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAP3P28838 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LAP3P28838 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAP3P28838 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAP3P28838 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAP3P28838 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAP3P28838 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAP3P28838 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LAP3P28838 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAP3P28838 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAP3P28838 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAP3P28838 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAP3P28838 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAP3P28838 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAP3P28838 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAP3P28838 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAP3P28838 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAP3P28838 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAP3P28838 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAP3P28838 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAP3P28838 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAP3P28838 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAP3P28838 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAP3P28838 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAP3P28838 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAP3P28838 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAP3P28838 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAP3P28838 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAP3P28838 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAP3P28838 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAP3P28838 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LAP3P28838 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LAP3P28838 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAP3P28838 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAP3P28838 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAP3P28838 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAP3P28838 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAP3P28838 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAP3P28838 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAP3P28838 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAP3P28838 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAP3P28838 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAP3P28838 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAP3P28838 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LAP3P28838 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAP3P28838 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAP3P28838 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LAP3P28838 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAP3P28838 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAP3P28838 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAP3P28838 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAP3P28838 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms