Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VARSP26640 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VARSP26640 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VARSP26640 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VARSP26640 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VARSP26640 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VARSP26640 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VARSP26640 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VARSP26640 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VARSP26640 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VARSP26640 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VARSP26640 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VARSP26640 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VARSP26640 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VARSP26640 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VARSP26640 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VARSP26640 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VARSP26640 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VARSP26640 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VARSP26640 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VARSP26640 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VARSP26640 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VARSP26640 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VARSP26640 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VARSP26640 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VARSP26640 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VARSP26640 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VARSP26640 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VARSP26640 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VARSP26640 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VARSP26640 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VARSP26640 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VARSP26640 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VARSP26640 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VARSP26640 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VARSP26640 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VARSP26640 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VARSP26640 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VARSP26640 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VARSP26640 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VARSP26640 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VARSP26640 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VARSP26640 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VARSP26640 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VARSP26640 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VARSP26640 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VARSP26640 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VARSP26640 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VARSP26640 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VARSP26640 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VARSP26640 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VARSP26640 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VARSP26640 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VARSP26640 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VARSP26640 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VARSP26640 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VARSP26640 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VARSP26640 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VARSP26640 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VARSP26640 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VARSP26640 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VARSP26640 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VARSP26640 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VARSP26640 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VARSP26640 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VARSP26640 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VARSP26640 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VARSP26640 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VARSP26640 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VARSP26640 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VARSP26640 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VARSP26640 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VARSP26640 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VARSP26640 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VARSP26640 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VARSP26640 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VARSP26640 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VARSP26640 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VARSP26640 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VARSP26640 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VARSP26640 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VARSP26640 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VARSP26640 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VARSP26640 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VARSP26640 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VARSP26640 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VARSP26640 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VARSP26640 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VARSP26640 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VARSP26640 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VARSP26640 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VARSP26640 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VARSP26640 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VARSP26640 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VARSP26640 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VARSP26640 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
VARSP26640 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VARSP26640 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VARSP26640 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VARSP26640 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms