Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP5F1P24539 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP5F1P24539 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5F1P24539 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP5F1P24539 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms